登場時からの差異
一次車と二次車の違い
※1201F,1501F,1502Fは一次車、1202F~1206F,1503F~1509Fは二次車、1207F~1213Fは三次車と呼ばれることがあります。
前面貫通扉
前面貫通扉に取っ手がついているタイプとついていないタイプがあります。
新製時より取っ手付きの扉が取り付けられている車両は一次車の電連付き先頭車1201,1501,1601,1502,1602で、これら以外の車両は取っ手ナシで登場しました。2010年2月の検査の際に、1603のみ取っ手付きの扉に交換されました。
転落防止幌
一次車(1201F,1601F,1602F)にはヒンジなしのものが、それ以降はヒンジ付きのものが設置されています。高さは一緒ですが、妻面側にはヒンジのロック解除用のハンドルが設置されています。
側面表示灯
一次車のみ「：タイプ」、それ以降は戸閉灯が大型化された「ｉタイプ」です。
床下機器の泥除け板(2連)
車端部付近、台車と電灯接触器の間の泥除け板が二次車から設置されています。
台車
新製時は一次車のうち1201,1251,1601,1502の運転台側台車に砂箱が設置されていましたが、2007年10月のデビューを前に撤去されました。2007年7月の試運転時には全車ヨーダンパなしでしたが、8月の試運転では1251,1301にヨーダンパが設置されている姿が、9月には1301のヨーダンパが撤去され1251のみ設置の形態が確認されています。1251のヨーダンパは2011年2月の検査時に撤去されています。
二次車と三次車の違い
車内床模様
1207Fから暗色に変更されています。
前面塗分けの違い
1211Fのみ前頭部上部屋根側の橙色塗装領域が広く、正面から見たときにズレが見られます。
後年改造による差異
車体外観の変更
前面貫通扉の変更（2010.2）
2010年2月の検査の際に、1603のみ取っ手付きの扉に交換されました。
ヨーダンパ撤去（2011.2）
1251のヨーダンパは2011年2月の検査時に撤去されています。
クーラーキセ
1000系に搭載されるクーラーキセは、当初は一種類のみでしたが、2017年以降、5500系等と同じく二種類を混載しています。
前期型はCU-703、後期型はCU-703Aです。この記事では前者を前期型、後者を後期型として扱います。
クーラーキセは全般検査時に交換されています。
調査結果(2017年~)
※(括弧)内の数字は年月日を表します。括弧が付いていない場合は調査期間中に変更がなかったことを表します。
1201F~1212F：全車後期型
1213F(2018.1~):1313のみ前期型へ交換
1601F～1603F：全車後期型
1604F(2017.12~)：1504のみ前期型へ交換
1605F~1609F：全車後期型
前照灯交換（2015.9～）
LED前照灯への交換時期の一覧です。*付きは検査によらない交換です。
上写真の一枚目が小糸製LED前照灯、二枚目が森尾製です。
| 1201F | 2016.3* | 1601F | 2017.3 |
| 1202F | 2016.3* | 1602F | 2017.8 |
| 1203F | 2018.7 | 1603F | 2018.12* |
| 1204F | 2019.1 | 1604F | 2017.12 |
| 1205F | 2018.12* | 1605F | 2017.11* |
| 1206F | 2019.1* | 1606F | 2018.8* |
| 1207F | 2017.1* | 1607F | 2018.8? |
| 1208F(小糸) | 2014.5* | 1608F | 2018.12 |
| 1208F(森尾) | 2016.5* | 1609F | 2018.11* |
| 1209F | 2017.12* | ||
| 1210F | 2015.9* | ||
| 1211F | 2016.6 | ||
| 1212F | 2017.4 | ||
| 1213F | 2018.1 |
扉誤扱防止装置（2021.2）
車両がホームから外れた状態でドアを開けるといった「扉誤扱」を防止する装置が、1000系の1編成(1205～1255)に設置されました。装置は、車両の先頭部側下面に取付けられた超音波センサや、車内に設置された制御装置や報知ボックスなどから構成されます。
装置の設置後は、梅田～石屋川、大物～姫路、近鉄奈良～大物の3つの区間にわけて機器の動作状況を確認する試運転が2日ずつ実施されました。車両が通常入線する区間のすべてで試運転が実施されたことになります。時速数キロ程度の速度で、試験対象である各駅の停止位置目標前後を通過している様子が確認されました。
試験後は他車への波及などもなく、残置されています。詳細は以下のリンクをご覧ください。
貫通扉ワイパー撤去（2025.4~）
2025年4月の1213F検査出場以降、検査の際に貫通扉ワイパー撤去が進められています。
1213F：2025.4 1202F：2025.8
エクステリアデザイン変更（2025.8.25～）
2025年8月29日より、エクステリアデザイン変更車が運用開始しています。
エクステリアデザイン変更にあわせて、車いす・ベビーカーのピクトグラムステッカーが幕板にも追加で貼付されています。
デザイン変更時期
1202F:2025.8 1605F:2026.2
車内仕様変更
HANKYU HANSHIN WELCOME Wi-Fi設置（2020～2021）
車内サービス充実の一環として、訪日外国人向け車内無料Wi-Fiサービス「HANKYU HANSHIN WELCOME Wi-Fi」が車内にも導入されました。このWi-Fiサービスは2013年12月21日から阪急阪神ホールディングスグループの駅や商業施設で供用されていましたが、9000系と1000系全車にもWi-Fi 機器を新たに設置し、車内でも利用可能になりました。
9000系では、先頭車は運転台直後に機器箱が設置され、中間車は編成中央側の妻引戸鴨居部に、中間車については旗差しの撤去も併せて施工されました。また、Wi-Fi搭載車には機器箱のある側の車番付近にのみHANKYU HANSHIN WELCOME Wi-Fiステッカーが貼付されています。
1000系ではWi-Fi機器は天井中央列に格納され、ステッカー貼付位置は先頭車は運転台後部、中間車は大阪方妻面でした。
車内抗菌(2020年度)
車内防犯カメラ設置（2023～2024年度）
1000,9000,9300,5500(5550),5700系全車への車内防犯カメラの設置が2023~24年度に施工されました。防犯カメラは車内案内表示器付近の天井部に設置され、取付部はいずれの形式も蛍光灯台座が一段下がる形となっています。1000,5550,5700系の取付部の蛍光灯ソケット台座は、側面に2つ穴があるタイプとないタイプの２種類が存在します。穴の有無が施工時期によるものなのか定かではありませんが編成内ではそろっているようです。また、角部に透明樹脂カバーが装着されている（穴の有無には関係なく独立）ものもありますが、こちらは編成内で統一されていません。
二つ穴ありの編成
1000系(現状把握分)
1201F, 1202F, 1203F, 1204F, 1207F
5700系(全車調査済)
5703F, 5705F, 5709F, 5715F, 5717F, 5719F, 5725F
二つ穴ナシの編成
1000系6連車(1205F, 1210Fは未調査)の上記以外の編成
5551Fと5700系の上記以外の編成
優先座席フロアシート追加（2026.2）
